E-faktury, ISDOC a ViDA: co platí v Česku a co se chystá

Autor: Podklady včas (Grapher s.r.o.)Publikováno 18. 10. 2026Aktualizováno 18. 10. 2026Čtení cca 5 min

Kolem e-faktur koluje hodně zmatku. Často se plete „faktura poslaná e-mailem“ s „e-fakturou“ a slyšíme, že povinnost „brzy přijde“. Tento článek shrnuje, co skutečně platí v Česku k 18. 10. 2026, co mění evropský balíček ViDA, jak to má Slovensko a co z toho plyne pro účetní kancelář.

PDF faktura vs. e-faktura

Pro zákon o DPH má daňový doklad elektronickou podobu tehdy, když je vystaven i obdržen elektronicky. S elektronickou podobou musí souhlasit odběratel.¹ V tomto smyslu je elektronickým dokladem i obyčejné PDF poslané e-mailem.

Strukturovaná e-faktura je ale něco víc. Podle evropské směrnice 2014/55/EU je to faktura vystavená, předaná a přijatá ve strukturovaném elektronickém formátu, který umožňuje automatizované zpracování, v souladu s evropskou normou EN 16931-1:2017.² Rozdíl je jednoduchý:

• PDF je „obrázek“ faktury. Člověk ho přečte, počítač musí údaje odhadovat (vytěžovat).
• Strukturovaná e-faktura (např. ISDOC, UBL) je datový soubor. Počítač údaje přebírá přesně, bez odhadu.

Co je ISDOC

ISDOC je český národní standard elektronické faktury. Původně ho vytvořila pracovní skupina ICT Unie, dnes se o jeho rozvoj stará Ministerstvo vnitra. Aktuální verze je 6.0.2 z 23. 3. 2022.³ Prakticky se setkáte se třemi podobami:⁴

• .isdoc: samotný XML soubor s údaji faktury,
• .isdocx: archiv ve formátu ZIP, do kterého lze k faktuře přibalit i další soubory,
• ISDOC.PDF: běžné PDF (formát PDF/A-3) s vloženým ISDOC souborem. Člověk vidí fakturu, program si přečte data.

ISDOC zvládne i dobropis a vrubopis, zálohovou fakturu, zjednodušený daňový doklad nebo neplatební dokument.⁴ Většina českých účetních programů ho umí načíst i vystavit. Pro POHODU je postup popsaný v článku Import faktur do POHODY.

Co platí v Česku dnes

• Mezi firmami (B2B): obecnou povinnost vystavovat strukturované e-faktury jsme k 18. 10. 2026 v platném právu ani v projednávaných návrzích nenašli. Sněmovní tisk 218, novela zákona o DPH k evropským předpisům, kterou vláda předložila 5. 6. 2026, se týká hlavně zvláštních režimů OSS, elektronických rozhraní (platforem) a režimu skladu. Povinnou e-fakturaci nezavádí. Rozpočtový výbor ji 17. 9. 2026 doporučil schválit a je zařazena na pořad 34. schůze Sněmovny (od 13. 10. 2026).⁵⁶
• Vůči státu (B2G): veřejní zadavatelé musí přijímat a zpracovávat e-faktury podle normy EN 16931-1:2017. Pro ústřední orgány státní správy to platí od 31. 12. 2018 podle usnesení vlády, pro zadavatele podle zákona o zadávání veřejných zakázek od 1. 4. 2019, resp. 1. 4. 2020.² Povinnost se týká přijímání. Dodavatel státu e-fakturu posílat nemusí, ale může.

Shrnuto: k 18. 10. 2026 smíte dál posílat i přijímat PDF a papír (papír i PDF musí mít náležitosti daňového dokladu).

ViDA: co mění EU

ViDA (VAT in the Digital Age, „DPH v digitální době“) je balíček evropských předpisů o DPH. Hlavní část tvoří směrnice Rady (EU) 2025/516.⁷ Podle Evropské komise:⁸

Pro většinu malých českých firem je klíčové datum 1. 7. 2030, a to jen pro faktury do jiných členských států. Zda a kdy Česko zavede povinnou e-fakturaci i doma, zatím rozhodnuto není (viz výše).

Slovensko od roku 2027

Pokud máte klienty se slovenskými obchodními partnery, sledujte Slovensko. Zákon č. 385/2025 Z. z. novelizoval slovenský zákon o DPH a podle Finanční správy SR je legislativa elektronické fakturace účinná od 1. 1. 2027. E-faktury se doručují přes síť Peppol prostřednictvím certifikovaných poskytovatelů.⁹ Podrobnosti, například kdo přesně je povinen, popisuje Finanční správa SR.

Jak se připravit

• Ověřte svůj účetní program: umí import a export ISDOC? Plánuje výrobce podporu formátů podle EN 16931 (UBL, CII) a Peppol?
• Požádejte dodavatele klientů o ISDOC nebo ISDOC.PDF. Účetní pak nemusí nic opisovat.
• Fakturujete státu? Zjistěte, jakým kanálem zadavatel e-faktury přijímá.
• Klienti obchodující se Slovenskem by se měli zeptat svých partnerů, jak budou od roku 2027 fakturovat.
• Mezitím vytěžujte. Dokud chodí PDF a papír, šetří čas vytěžování s kontrolou člověkem. Víc v průvodci vytěžováním.
• Sledujte zdroje: Sněmovnu (psp.cz), Finanční správu a Ministerstvo financí. Stav se může změnit.

Časté otázky

Je v Česku e-faktura povinná?
Mezi podnikateli k 18. 10. 2026 ne, jsme nenašli žádnou takovou povinnost. Veřejní zadavatelé musí e-faktury přijímat.²

Je PDF e-mailem „elektronická faktura“?
Pro zákon o DPH ano, je to daňový doklad v elektronické podobě, pokud s tím odběratel souhlasí.¹ Strukturovaná e-faktura to ale není.

Jak otevřít soubor ISDOC?
Nejlépe v účetním programu přes import. ISDOC.PDF otevřete jako běžné PDF, data si program přečte z přílohy.

Slovníček zkratek

• EN 16931: evropská norma, která určuje, jaké údaje má e-faktura obsahovat a v jaké struktuře.²
• UBL a CII: dvě technické „syntaxe“ (způsoby zápisu XML), které norma připouští. UBL 2.1 je zároveň norma ISO/IEC 19845:2015, CII vydává UN/CEFACT.²
• ISDOC: český národní formát. Stát ho přijímá od verze 5.2.²
• Peppol: mezinárodní síť pro doručování elektronických dokumentů mezi firmami přes certifikované poskytovatele. Používá ji třeba slovenské řešení.⁹
• B2B, B2G: obchod mezi firmami (business to business) a dodávky státu (business to government).
• DRR (Digital Reporting Requirements): digitální hlášení údajů z faktur správci daně, podle ViDA u přeshraničních plnění od 1. 7. 2030.⁸
• OSS a IOSS: zvláštní režimy „jednoho správního místa“, přes které se přiznává DPH z některých prodejů do jiných států EU bez registrace v každém z nich.